El 14 de agosto de 2013 se publicó en el Boletín Oficial el decreto que designó a Carlos Gonella como fiscal ante el Tribunal Oral en lo Criminal Federal de Formosa, cargo al que accedió a través del Concurso 75 del Ministerio Público Fiscal.

Hasta el momento, sin embargo, Gonella no asumió su cargo en Formosa. Entre diciembre de 2012 y mayo de 2016, fue titular de la Procuraduría de Criminalidad Económica y Lavado de Activos (Procelac), la fiscalía antilavado creada por la procuradora general de la Nación, Alejandra Gils Carbó. En mayo de 2016 pasó a desempeñarse en la Unidad de Litigio Oral Estratégico de la Procuración General de la Nación.

Gonella nació en 1975 en Oliva, provincia de Córdoba. Antes de su llegada a la Procelac, había trabajado en la Secretaría de Derechos Humanos de un juzgado federal de su provincia. En 2008 ingresó al Ministerio Público Fiscal como secretario de la Fiscalía ante el Tribunal Oral en lo Criminal Federal N° 2 de Córdoba, en la que un año después, por resolución del procurador Esteban Righi, pasó a desempeñarse como fiscal subrogante.

Righi, además, lo designó para integrar una comisión que investigó la causa de la explosión de la Fábrica Militar de Río Tercero. También quedó al frente de múltiples causas por violación a los derechos humanos durante la última dictadura. En diciembre de 2010, con Gonella como fiscal, se produjo en Córdoba la primer condena por lavado de dinero en Argentina desde la vigencia de la ley de lavado, sancionada en 2000.

Es integrante de Justicia Legítima y acumula dos importantes causas en su contra en los tribunales de Comodoro Py. En diciembre de 2014 el juez Marcelo Martínez de Giorgi lo procesó por presuntas irregularidades en la investigación de la causa por lavado de dinero que involucra al empresario Lázaro Báez.

Además, fue llamado a indagatoria por el juez Claudio Bonadio por el delito de violación de secreto a partir de una denuncia de una jueza. Gonella difundió en su cuenta de twitter un dictamen de otro fiscal publicado por la agencia de noticias del Ministerio Público Fiscal en el que se señalaba la relación de esta magistrada con un narcotraficante condenado a 20 años de prisión. Gonella no se presentó a la indagatoria. Bonadío lo declaró en rebeldía y prohibió que el fiscal saliera de país, decisión que fue revocada por la Cámara Federal.