Carlos Alberto Mahiques nació el 1 de noviembre de 1951 en Mercedes, Provincia de Buenos Aires. Obtuvo su título de abogado el 30 de julio de 1974 en la Universidad Nacional de La Plata.

En 1976 ingresó al Poder Judicial de la Provincia de Buenos Aires, con el cargo de Secretario Letrado de un juzgado de primera instancia en materia penal. En 1993 fue designado juez del Tribunal Oral en lo Criminal Nº 6 de la Justicia Nacional. El 5 de abril del 2000 fue designado juez del Tribunal de Casación Penal de la Provincia de Buenos Aires.

Participó del Concurso Nº 220 del año 2008 destinado a cubrir los diez cargos de la recién creada Cámara Nacional de Casación Penal. En el 2010 el Consejo de la Magistratura envió su nombre al Poder Ejecutivo en el 6º lugar del orden de mérito, el cual envió su pliego al Senado recién el 25 de junio de 2013. El Senado aprobó el pliego -que no recibió impugnaciones- el 31 de julio de 2013 y fue designado en el cargo el 5 de noviembre del mismo año.

En diciembre de 2015 dejó su despacho en Tribunales y asumió como ministro de Justicia de la Provincia de Buenos Aires, nombrado por la gobernadora, María Eugenia Vidal. A fines de mayo de 2016 renunció y volvió a la Cámara de Casación porteña, de donde se había ido con licencia.

Tras la renuncia de Pedro David, Mahiques solicitó al Consejo de la Magistratura de la Nación ser trasladado a la Cámara Federal de Casación Penal, el máximo tribunal penal del país. Dicha solicitud fue avalada por el Consejo de la Magistratura, El traslado de Mahiques tuvo ocho votos a favor y cuatro en contra. Votaron a favor los legisladores de Cambiemos que integran el Consejo, los jueces Leónidas Moldes y Luis María Cabral, los abogados Adriana Donato y Miguel Piedecasas y el académico Jorge Candis. En contra votaron los legisladores Rodolfo Tailhade, Virginia García y Ruperto Godoy y la jueza Gabriela Vázquez. Juan Mahiques, hijo de Carlos Mahiques, no intervino en el plenario.

El Consejo fundamentó la designación de Mahiques en que se trata de tribunales de idéntica jerarquía y jurisdicción territorial, y en que aún no se abrió un concurso para esta vacante. Los consejeros que votaron a favor argumentaron que la Casación ordinaria, en la que se desempeñaba Mahiques, es un tribunal nuevo, por lo que no se vería afectado su funcionamiento y señalaron que, si bien existe un reglamento que exige un mínimo de cuatro años de antigüedad para solicitar traslados (Mahiques no lo cumple), las demás razones expuestas permiten “prescindir” de ese requisito.

El consejero Tailhade, quien además es diputado del Frente para la Victoria (FpV), señaló que Mahiques no sólo no tenía la antigüedad necesaria, sino que no tiene la competencia requerida, ya que es un juez nacional, no federal. Para Cabral se trata de dos tribunales federales y lo único que los diferencia es el tipo de delitos que tratan.

En el Consejo de la Magistratura actualmente tramita un concurso para cubrir las otras cuatro vacantes que existen en la Cámara de Casación Federal desde antes de la renuncia de David. Este concurso se inició en mayo de 2012, es decir, hace cinco años. Desde mayo de 2015 el plenario del Consejo tiene en consideración las ternas aprobadas por la Comisión de Selección, pero desde entonces no hay mayorías suficientes para su aprobación. En el caso de Mahiques, a menos de un mes de generada la vacante, el Consejo le dio al Gobierno la potestad de nombrar a un juez titular sin necesidad de pasar por un concurso.

Mahiques es Doctor en Ciencias Jurídicas por la Universidad Católica Argentina y Doctor en Derecho por la Université de Droit et Sciences Sociales, Francia.

Es Profesor Titular Ordinario de Derecho Penal desde septiembre de 2001 en la Universidad Católica Argentina. También es docente del Doctorado en Ciencias Jurídicas de la UCA y de la Maestría en Derecho Penal y Justicia Internacional de la Universidad Kennedy.

En el 2006 fue muy discutida su participación en la causa “LMR” como subrogante en la Suprema Corte de Justicia de la Provincia de Buenos Aires, en donde votó contra la realización de un aborto no punible a una joven con discapacidad mental que había sufrido una violación por parte de su tío.

Con la asunción de Mauricio Macri en la Presidencia, su hijo Juan Bautista Mahiques fue nombrado subsecretario de Relaciones con el Poder Judicial y Asuntos Penitenciarios de la Nación, en el Ministerio de Justicia a cargo de Germán Garavano. Juan Bautista es, además, el representante del Poder Ejecutivo en el Consejo de la Magistratura.

El otro hijo de Carlos Mahiques, Ignacio Mahiques, es fiscal de instrucción porteño, pero desde mayo de 2016 se desempeña como adjunto del fiscal federal Gerardo Pollicita en la causa en la que fue procesada Cristina Fernández de Kirchner por presunta corrupción en el reparto de la obra pública durante su gobierno.