Guillermo Marijuán nació en 1966 y se recibió de abogado en la Universidad de Buenos Aires (UBA). En la década del ‘80 ingresó como meritorio a trabajar en la Justicia Federal, en el juzgado a cargo de Amelia Berraz de Vidal, en el que en ese entonces también se iniciaba el hoy camarista Eduardo Farah.

Al poco tiempo dejó el juzgado y comenzó a trabajar en la Fiscalía Federal N° 4, que conducía Carlos Beraldi, ex socio de León Arslanian. Tuvo un paso por la Cámara Federal, en la que llegó al cargo de secretario y en 1993 fue designado fiscal federal adjunto en la Fiscalía Federal N° 12, que estaba a cargo de Oscar Almirante.

En 2002 Marijuán quedó al frente de la Unidad de Fiscal de Investigaciones de la Seguridad Social (Ufises), una área del Ministerio Público Fiscal creada por el entonces procurador Nicolás Becerra. Dos años más tarde, ya con Esteban Righi como titular de la Procuración, Marijuán, que aún era adjunto en la Fiscalía N° 12, solicitó su traslado a la Fiscalía Federal N° 9, que se encontraba vacante por la renuncia de Eamon Mullen. Righi aceptó y lo designó titular de esa Fiscalía.

Desde 2013 tiene a su cargo la investigación de la causa por lavado de dinero contra el empresario Lázaro Báez. A fines de 2014 la procuradora general de la Nación, Alejandra Gils Carbó, lo removió de la Ufises, aunque a los pocos días el juez federal Enrique Lavié Pico lo devolvió a su cargo.